Các HTX đều tập trung vào các dịch vụ phục vụ sản xuất nông nghiệp, sản xuất theo kế hoạch, lịch thời vụ hằng năm; đã không ngừng đổi mới phương thức quản lý, điều hành, đổi mới tư duy trong kinh doanh nhằm mang lại hiệu quả kinh tế thiết thực... Các HTX đã hỗ trợ, thúc đẩy phát triển kinh tế thành viên và hộ gia đình, thúc đẩy sản xuất phát triển, tăng thu nhập cho thành viên và hộ gia đình; góp phần xây dựng xã nông thôn mới, tái cơ cấu sản xuất ngành nông nghiệp, thực hiện Chương trình Mỗi xã một sản phẩm (OCOP)... Nhiều HTX đã chú trọng đầu tư ứng dụng các tiến bộ kỹ thuật, cơ giới hóa nông nghiệp, mở thêm các ngành nghề tiểu thủ công nghiệp, dịch vụ phục vụ thiết thực cho lợi ích kinh tế thành viên và lợi ích cộng đồng.
Tuy nhiên, hiện nay lĩnh vực HTX nông nghiệp vẫn còn một số tồn tại: quy mô hoạt động của HTX còn nhỏ, thiếu vốn, thiếu cơ sở vật chất, nội dung hoạt động còn đơn điệu, dịch vụ phục vụ đời sống hộ thành viên chưa nhiều, sự liên kết giữa các HTX với nhau và giữa HTX với doanh nghiệp còn hạn chế.