Ban Quản lý Chương trình 1125 có 17 thành viên, 01 thư ký, do ông Nguyễn Văn Hai, Giám đốc Sở Y tế làm Trưởng Ban; ông Nguyễn Văn Văn, Phó Giám đốc Sở Y tế làm Phó Trưởng Ban trực; ông Huỳnh Thế Vịnh, Phó Giám đốc Sở Y tế làm Phó Trưởng Ban.
Ban Quản lý Chương trình 1125 có nhiệm vụ xây dựng kế hoạch cụ thể triển khai thực hiện Chương trình trên địa bàn tỉnh đảm bảo đạt mục tiêu, chỉ tiêu đề ra. Phối hợp với Sở Tài chính lập kế hoạch sử dụng ngân sách trình Ủy ban nhân dân tỉnh quyết định theo quy định của Luật Ngân sách nhà nước để triển khai thực hiện Chương trình. Triển khai công tác truyền thông, tổ chức kiểm tra, giám sát, đánh giá, sơ kết, tổng kết Chương trình trên địa bàn tỉnh, định kỳ báo cáo kết quả thực hiện với Ủy ban nhân dân tỉnh và Bộ Y tế.